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华中农大建成全球首个水稻基因索引数据库

  华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组近日发表最新研究成果,他们建成世界上首个基于同源基因的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。

  据介绍,这个数据库如同一本近义词词典。在数据库里,亚洲稻的每一个基因都能轻松找到同源或相近的基因,以及追踪其演变历史。目前,数据库储存于华中农业大学,向全球开放免费使用。

  亚洲栽培稻是世界一半人口的主食。据记载,全球共有多达78万份水稻种质材料,其中国际水稻研究所种质资源库里收藏的亚洲稻种质及其野生近缘种就达13万多份。张建伟教授课题组所建成的水稻基因索引数据库,是从13万多份亚洲稻种质中选取具有遗传多样性代表的3000份核心种植资源,再从3000份中选取最具代表性的16份,完成全基因组测序及基因注释,作为其基本数据信息。

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