中国荷斯坦牛基因组选择育种芯片正式发布

　　本报讯  （记者 杨晓晶）日前，首农食品集团北京奶牛中心、中国农业大学、华智生物技术有限公司在第三十届中国北京种业大会上联合发布中国荷斯坦牛基因组选择育种芯片。此举标志着我国在荷斯坦牛中高密度SNP育种芯片自主设计开发方面取得重要突破，为保障我国奶牛自主选育体系的稳定运行与生物信息安全提供了重要技术支撑。

　　“近年来，我国加速构建和优化奶牛基因组选择育种技术平台，但过去依赖于国外育种芯片，国内种牛检测样品需要送到国外实验室检测，存在技术卡点及生物信息安全风险。”“十四五”国家重点研发计划项目首席科学家、中国农业大学教授孙东晓表示。在奶牛基因组选择育种时代，高通量SNP检测技术平台堪称育种“芯片”，为了实现我国国产奶牛育种芯片零的突破，2020年8月，北京奶牛中心与华智生物技术有限公司签订技术合作协议，并联合中国农业大学启动奶牛育种芯片自主设计开发攻关工作。

　　据介绍，攻关团队对奶牛育种芯片进行了一系列科学、严谨的设计、验证和反复论证。攻关团队基于联合承担的国家“863”计划、北京市科委奶牛繁育重大专项等科研成果，基于中国荷斯坦牛群体挖掘验证一大批效应显著的基因突变位点；将上述位点与遗传缺陷位点、亲子鉴定位点、其他多组学来源数据位点以及多款商业化芯片位点进行整合；利用大样本量检测实验，通过多轮体系优化与验证，于2021年4月完成了奶牛85K液相育种芯片自主开发，并通过专家论证。通过6000头荷斯坦牛样本对比检测验证，该款芯片在检出率、分型准确性、基因型填充准确性等性能上与国际商业化育种芯片一致。