受国际金融危机的影响，2009年我国对外贸易遭遇严寒，进出口总额同比下降13.9%。医药行业在经历了2008年及2009年上半年的艰难之后，在2009年下半年进出口形势迅速回暖，与我国整体外贸形势形成反差，进出口总额同比增速达到9.8%。
中药对外贸易重拾升势，进出口总额突破20亿美元，同比增速位居医药各类商品（西药类、医疗器械类、中药类）之首，增长幅度达14.36%，为2007年以来的最高水平。其中，中药类商品出口额为14.6亿美元，同比增长11.72%，比2008年高出3个百分点；进口额为5.4亿美元，同比增长22.14%，比2008年高出1.6个百分点，达到近6年来的最高点。
1对外贸易继续保持顺差，但出口增幅低于进口增幅10个百分点
2009年中药类商品对外贸易继续保持顺差，顺差额达到9.2亿美元，但出口增幅低于进口增幅10个百分点。在各单项商品中，植物提取物和中药材贸易均为顺差，提取物出口占中药类产品出口总额的44.8%，位居首位；中药材饮片出口占中药类产品出口总额的37.92%，位居第二；中成药和保健品贸易出现逆差，中成药贸易是继2008年后第二次出现逆差，且逆差额略有增加；保健品贸易除2006年外，自2003年起一直呈现逆差，2009年逆差额达到2314.5万美元，是逆差额最高的一年。
2一般贸易为中药进出口主要方式，边境小额贸易成亮点
从贸易方式上看，一般贸易仍为中药进出口的主要方式。2009年，以一般贸易方式出口的中药产品占中药总出口额的83.73%；以一般贸易方式进口的中药产品占中药总进口额的68.97%。在进口贸易中，进料加工贸易占比为17.14%，在出口贸易中，进料加工贸易占比为7.89%。保税区仓储转口货物贸易是中药进口的一种特色方式，2009年以此方式进口的中药商品量达到21754吨。边境小额贸易方式是中药出口的又一特色，2009年以此方式出口的中药商品量达到31875吨，是除一般贸易外，出口数量最多的贸易方式。
2009年，中药类产品出口企业共计2766家，民营企业成为出口的主力军，出口金额占比高达41.14%；三资企业出口金额占比为33.78%；国有企业退出了中药类产品出口第一军团的位置，出口金额占比仅为24.87%。值得关注的是，在民营企业中，私人企业的出口量占九成以上。
从事中药类产品进口的企业为1380家，其中三资企业进口势头强劲，进口金额高达2.7亿美元，占比达49.73%。外商独资企业是三资企业中的主要力量，进口金额高达1.9亿美元；民营企业进口金额为2.1亿美元，占比39.07%；国有企业进口额仅为6000万美元，占比为11.18%。
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